Действие фильма разворачивается в 1944 году. Главный герой фильма «Первый после Бога» – капитан Александр Маринин (Дмитрий Орлов) – заслужил среди подчиненных и товарищей репутацию отважного и благородного человека. Однако, в его родословной имеется пункт, способный смутить любого: отец Александра был белогвардейцев, сбежавшим в годы гражданской войны.
В связи с этим Маринин постоянно находится под наблюдением спецслужб – по подозрению в укрывательстве своего брата.Обвинение, не требующее особых доказательств, в короткие сроки приводит Александра в тюрьму. Однако, командир бригады подводных лодок (Владимир Гостюхин), получивший задание атаковать большой конвой фашистских войск, объявляет, что задание будет провалено, если в нем не будет участвовать Маринин. Поручившись за своего подчиненного, он дает ему шанс на реабилитацию… повреждение.